Fabrizio DAL PIAZ | PROTEOMICA, INTERATTOMICA E METABOLOMICA
Fabrizio DAL PIAZ PROTEOMICA, INTERATTOMICA E METABOLOMICA
cod. CB22100012
PROTEOMICA, INTERATTOMICA E METABOLOMICA
| CB22100012 | |
| DIPARTIMENTO DI CHIMICA E BIOLOGIA "ADOLFO ZAMBELLI" | |
| CORSO DI LAUREA MAGISTRALE | |
| BIOLOGIA | |
| 2026/2027 |
| ANNO CORSO 1 | |
| ANNO ORDINAMENTO 2025 | |
| PRIMO SEMESTRE |
| SSD | CFU | ORE | ATTIVITÀ | ||
|---|---|---|---|---|---|
| PROTEOMICA, INTERATTOMICA E METABOLOMICA (MOD. BIO/10) | |||||
| BIO/10 | 2 | 16 | LEZIONE | ||
| BIO/10 | 1 | 12 | LABORATORIO | ||
| PROTEOMICA, INTERATTOMICA E METABOLOMICA (MOD. BIO/12) | |||||
| BIO/12 | 2 | 16 | LEZIONE | ||
| BIO/12 | 1 | 12 | LABORATORIO | ||
| Obiettivi | |
|---|---|
| Obiettivo generale Il corso è finalizzato a fornire le basi teoriche della proteomica, dell’interattomica e della metabolomica, attraverso lo studio delle proprietà strutturali delle molecole di interesse, lo studio delle metodiche analitiche utilizzate in queste discipline (quali ad esempio cromatografia, elettroforesi, spettrometria di massa, risonanza magnetica nucleare) e i principi chimico-fisici alla loro base. Oltre agli aspetti teorici, saranno studiati aspetti pratici delle tecniche sperimentali maggiormente usate, dei metodi bioinformatici per l’analisi ed interpretazione dei dati. Conoscenza e capacità di comprensione Lo studente acquisirà conoscenze sulle tecniche sperimentali e sull’analisi dei dati, e sarà in grado di comprendere i principali studi presenti nella letteratura scientifica internazionale in cui le tecniche vengono utilizzate. Capacità di applicare conoscenza e comprensione Lo studente sarà in grado di applicare le conoscenze acquisite sulle tecniche sperimentali e sull’analisi dei dati, anche mediante applicazioni pratiche svolte durante le esercitazioni. Autonomia di giudizio Lo studente sarà in grado di valutare la adeguatezza di dati ottenuti sperimentalmente dagli approcci omici per le analisi da realizzare mediante strumenti bioinformatici, inoltre sarà in grado di selezionare il tipo di analisi e gli strumenti di elaborazione dei dati più idonei. Abilità comunicative Lo studente sarà in grado di comunicare, mediante esposizione orale o con l’aiuto di supporti informatici, i risultati di elaborazioni proprie su dati utilizzati per le esercitazioni Capacità di apprendimento Lo studente sarà in grado di utilizzare strumenti bioinformatici per l’analisi dei dati sperimentali prodotti con approcci omici. Inoltre, sarà in grado di utilizzare strumenti bibliografici per aggiornare le proprie conoscenze. |
| Prerequisiti | |
|---|---|
| LO STUDENTE DEVE ESSERE IN POSSESSO DELLE CONOSCENZE BASE RELATIVA ALLA STRUTTURA E ALLA CHIMICA DELLE PROTEINE, DEI LEGAMI E DELLE INTERAZIONI CHE DETERMINANO IL RICONOSCIMENTO PROTEINA-LIGANDO, DELLE PRINCIPALI VIE METABOLICHE E DELLA STRUTTURA DEI PRINCIPALI METABOLITI PRIMARI DELLE CELLULE EUCARIOTICHE |
| Contenuti | |
|---|---|
| NELL’AMBITO DELL’INSEGNAMENTO PREVEDE SARANNO TRATTATI I SEGUENTI ARGOMENTI MODULO DI PROTEOMICA E INTERATTOMICA (2 CFU DIDATTICA FRONTALE + 1 CFU DI ESERCITAZIONI): CHIMICA DEGLI AMMINOACIDI E ORGANIZZAZIONE STRUTTURALE DELLE PROTEINE (2 ORE), LEGAMI ED INTERAZIONI (1 ORE), TURNOVER E OMEOSTASI PROTEICA (1 ORE), TECNICHE E PROTOCOLLI SPERIMENTALI PER L’ANALISI PROTEOMICA (ELETTROFORESI, SPETTROSCOPIA, CROMATOGRAFIA, SPETTROMETRIA DI MASSA, PEPTIDE MAPPING, WESTERN BLOTTING) (5 ORE), ELABORAZIONE DELLE INFORMAZIONI DA ANALISI PROTEOMICA (2 ORE), RUOLO DELLE INTERAZIONI PROTEICHE NEI SISTEMI BIOLOGICI (2 ORE), STUDIO DELLE INTERAZIONI MEDIANTE METODICHE BIOCHIMICHE E BIOFISICHE (3 ORE). ESERCITAZIONE: ANALISI DI DATI LC-MS/MS PER IDENTIFICAZIONE DELLE PROTEINE (3 ORE) ESERCITAZIONE: ANALISI DI DATI LC-MS/MS PER ANALISI QUANTITATIVA E CONFRONTO TRA CAMPIONI DIFFERENTI (3 ORE) ESERCITAZIONE: ELABORAZIONE BIOINFORMATICA MEDIANTE APPROCCI DI GENE ONTOLOGY DEI DATI PROTEOMICI (3 ORE) ESERCITAZIONE: STUDIO DI COMPLESSI PROTEICI A PARTIRE DA DATI DI PROTEOMICA E INTERATTOMICA (3 ORE) MODULO DI METABOLOMICA (2 CFU DIDATTICA FRONTALE + 1 CFU DI ESERCITAZIONI): INTRODUZIONE ALLA METABOLOMICA, DEFINIZIONI E RUOLO NELL'AMBITO DELLA BIOLOGIA DEI SISTEMI (2 ORE) RACCOLTA E PREPARAZIONE DEI CAMPIONI BIOLOGICI PER LE INDAGINI DI METABOLOMICA (2 ORE) LA SPETTROMETRIA DI MASSA NEGLI STUDI DI METABOLOMICA (2 ORE) LA CROMATOGRAFIA NEGLI STUDI DI METABOLOMICA (2 ORE) BASI DI DATI PER LE INDAGINI DI METABOLOMICA (PRETRATTAMENTI) (2 ORE: 1 LEZIONE FRONTALE + 1 ESERCITAZIONE) METODI E STRATEGIE CHEMIOMETRICHE NELL'ANALISI DEI DATI DI METABOLOMICA - I PARTE (ANALISI ESPLORATIVE) (2 ORE: 1 LEZIONE FRONTALE + 1 ESERCITAZIONE) METODI E STRATEGIE CHEMIOMETRICHE NELL'ANALISI DEI DATI DI METABOLOMICA - II PARTE (METODI DI APPRENDIMENTO NON SUPERVISIONATI) (2 ORE: 1 LEZIONE FRONTALE + 1 ESERCITAZIONE) METODI E STRATEGIE CHEMIOMETRICHE NELL'ANALISI DEI DATI DI METABOLOMICA - III PARTE (METODI SUPERVISIONATI) (2 ORE: 1 LEZIONE FRONTALE + 1 ESERCITAZIONE) OTTIMIZZAZIONE DEGLI IPERPARAMETRI E STRATEGIA DI VALIDAZIONE (2 ORE ESERCITAZIONE) FEATURES SELECTION IN METABOLOMICA (2 ORE ESERCITAZIONE) APPLICAZIONI METABOLOMICA TARGETED - LO SCREENING METABOLICO ALLARGATO (1 ORA) METABOLOMICA UNTARGETED (1 ORA ESERCITAZIONE) OMICHE DERIVATE - LIPIDOMICA, FLUSSOMICA ED ESPOSOMICA (1 ORA) PATHWAY ANALYSIS (1 ORA ESERCITAZIONE) SINGLE CELL METABOLOMICS (1 ORA) LA METABOLOMICA NELLO STUDIO DELLE PATOLOGIE ONCOLOGICHE (1 ORA) LA METABOLOMICA COME STRUMENTO DI MEDICINA DI PRECISIONE (1 ORA ESERCITAZIONE) PROSPETTIVE DIAGNOSTICHE DELLA METABOLOMICA (1 ORA ESERCITAZIONE) |
| Metodi Didattici | |
|---|---|
| MODULO DI PROTEOMICA E INTERATTOMICA: IL CORSO SI ARTICOLA IN LEZIONI FRONTALI (16 ORE TOTALI) ED INCONTRI DI ESERCITAZIONE (12 ORE TOTALI). LE LEZIONI FRONTALI SI SVOLGONO CON L'UTILIZZO DI DIAPOSITIVE, CON CONTINUI RIFERIMENTI AL LIBRO DI TESTO E AL MATERIALE DI STUDIO MESSO A DISPOSIZIONE, CON ESEMPI PRATICI DA ARTICOLI SCIENTIFICI SU PROGETTI DI RICERCA IN CUI SONO STATE UTILIZZATE LE TECNICHE DESCRITTE NELLE LEZIONI. LE ESERCITAZIONI PRATICHE PREVEDONO DIMOSTRAZIONI AL COMPUTER ED APPLICAZIONI MEDIANTE SOFTWARE ONLINE. MODULO DI METABOLOMICA: IL CORSO SI ARTICOLA IN 14 LEZIONI (28 ORE TOTALI DI CUI 16 DI LEZIONI FRONTALI E 12 SI ESERCITAZIONI). NEL CORSO DELLE LEZIONI FRONTALI VENGONO DESCRITTI I PRINCIPI ANALITICI E LE PRINCIPALI TECNOLOGIE IMPIEGATE NELLE INDAGINI DI METABOLOMICA, LE STRATEGIE, GLI ALGORITMI E GLI STRUMENTI BIOINFORMATICI NECESSARI ALLA ANALISI DEI DATI PRODOTTI, NONCHÉ LE PRINCIPALI APPLICAZIONI DELLA METABOLOMICA NELLO STUDIO DELLE PATOLOGIE UMANE. LE LEZIONI FRONTALI SONO ACCOMPAGNATE DA INCONTRI DI ESERCITAZIONI IN AULA FINALIZZATE ALLA SIMULAZIONE DI ALCUNI ESPERIMENTI “TIPO” PER MEZZO DELLA DEFINIZIONE DEL PIÙ APPROPRIATO DISEGNO SPERIMENTALE E DELLA CORRETTA IDENTIFICAZIONE DELLE STRATEGIE ANALITICHE E BIOINFORMATICHE. E', INOLTRE, PREVISTA UNA FASE DI ANALISI DI DATI PROVENIENTI DA ESPERIMENTI REALI. |
| Verifica dell'apprendimento | |
|---|---|
| IL RAGGIUNGIMENTO DEGLI OBIETTIVI DELL'INSEGNAMENTO VIENE VERIFICATO MEDIANTE UN ESAME CON VALUTAZIONE IN TRENTESIMI. LA PROVA D'ESAME SI SVOLGE DOPO IL TERMINE DEL CORSO, MEDIANTE UN COLLOQUIO IN DUE PARTI, UNA PER CIASCUNO DEI DUE MODULI DELL'INSEGNAMENTO, MIRATO AD ACCERTARE E VALUTARE IL LIVELLO DI CONOSCENZA E LA CAPACITÀ DI COMPRENSIONE RAGGIUNTA SUI CONTENUTI TEORICI E PRATICI DEL PROGRAMMA. LA VALUTAZIONE TIENE CONTO DELLA PROPRIETÀ DI LINGUAGGIO, DELL'AUTONOMIA DI ORGANIZZAZIONE DELL'ESPOSIZIONE, DELLA CAPACITÀ DI ELABORARE RISPOSTE ALLE DOMANDE POSTE ANCHE SULLE ATTIVITÀ PRATICHE SVOLTE NEL CORSO DELLE ESERCITAZIONI. IL VOTO FINALE, RELATIVO AD ENTRAMBI I MODULI E CON UGUAL PESO, TIENE CONTO DELLE CONOSCENZE ACQUISITE, DELLA PROPRIETÀ DI LINGUAGGIO, DELLA QUALITÀ DELL'ESPOSIZIONE E DELLA CAPACITÀ DI TROVARE SOLUZIONI NELLE ATTIVITÀ PRATICHE. IL VOTO MINIMO (18/30) VIENE RAGGIUNTO QUANDO LA PROVA D'ESAME DIMOSTRA IL RAGGIUNGIMENTO DI UN LIVELLO SUFFICIENTE NELLA CONOSCENZA, CAPACITÀ DI LINGUAGGIO, QUALITÀ DELL'ESPOSIZIONE. IL VOTO MASSIMO (30/30) VIENE RAGGIUNTO QUANDO LO STUDENTE DIMOSTRA CON LA PROVA D'ESAME UNA PIENA E COMPLETA CONOSCENZA E PROPRIETÀ DI LINGUAGGIO SUI TEMI AFFRONTATI, CON MASSIMA QUALITÀ DELL'ESPOSIZIONE E CAPACITÀ DI APPLICARE LE CONOSCENZE NELLE ATTIVITÀ PRATICHE. LA LODE VIENE ATTRIBUITA QUANDO LA PROVA D'ESAME DIMOSTRA, OLTRE AL MASSIMO RISULTATO POSSIBILE, UNA PARTICOLARE QUALITÀ DELL'ESPOSIZIONE CON CAPACITÀ DI ANALISI CRITICA. |
| Testi | |
|---|---|
| MODULO DI PROTEOMICA E INTERATTOMICA T. ALBERIO, M. FASANO, P. ROCADA. PROTEOMICA. EDITORE: EDISES EDIZIONI SRL NAPOLI, 2021. MODULO DI METABOLOMICA: J. TROISI, METABOLOMICS PERSPECTIVES: FROM THEORY TO PRATICAL APPLICATIONS. ACADEMIC PRESS, ELVEVIER, 2022 INOLTRE, DISPENSE DELLE LEZIONI, ARTICOLI SCIENTIFICI ATTINENTI E MATERILAE DIDATTICO FORNITO DAI DOCENTI |
| Altre Informazioni | |
|---|---|
| PARTICOLARE ATTENZIONE SARÀ POSTA AL COORDINAMENTO TRA I MODULI DEL CORSO E L'INTEGRAZIONE TRA I CONTENUTI DI QUESTO INSEGNMANTO E GLI ALTRI DEL CDS. |
BETA VERSION Fonte dati ESSE3 [Ultima Sincronizzazione: 2026-08-17]


