Luigi TROIANO | ARCHITECTURES AND SYSTEMS FOR BIOLOGICAL DATA PROCESSING
Luigi TROIANO ARCHITECTURES AND SYSTEMS FOR BIOLOGICAL DATA PROCESSING
cod. 0622900005
ARCHITECTURES AND SYSTEMS FOR BIOLOGICAL DATA PROCESSING
0622900005 | |
DIPARTIMENTO DI INGEGNERIA DELL'INFORMAZIONE ED ELETTRICA E MATEMATICA APPLICATA | |
CORSO DI LAUREA MAGISTRALE | |
DIGITAL HEALTH AND BIOINFORMATIC ENGINEERING | |
2020/2021 |
ANNO CORSO 2 | |
ANNO ORDINAMENTO 2018 | |
PRIMO SEMESTRE |
SSD | CFU | ORE | ATTIVITÀ | |
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ING-INF/05 | 3 | 24 | LEZIONE | |
ING-INF/05 | 3 | 24 | LABORATORIO |
Obiettivi | |
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L'INSEGNAMENTO HA IL FINE DI ANALIZZARE CON STRUMENTI BIOINFORMATICI LE SEQUENZE E LE STRUTTURE NUCLEOTIDICHE E PROTEICHE IN PARTICOLARE PER L'ALLINEAMENTO, LOCALE E GLOBALE, MULTIPLO DI SEQUENZE FONDAMENTALMENTE PROTEICHE, PER RILEVARE LA STRUTTURA E DARE UN'INTERPRETAZIONE AGLI ALBERI FILOGENETICI; CAPIRE LE BASI METODOLOGICHE DELLA BIOLOGIA DEI SISTEMI. ULTERIORMENTE HA COME OBBIETTIVO IL FORNIRE GLI STRUMENTI ARCHITETTURALI PER L’IMPLEMENTAZIONE DI MODELLI APPROPRIATI PER LA BIOLOGIA DEI SISTEMI E LA DIAGNOSTICA MEDICA. |
Prerequisiti | |
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SONO RICHIESTE OPPORTUNE CONOSCENZE ELEMENTARI DI BIOLOGIA MOLECOLARE, BIOINFORMATICA, MATEMATICA, STATISTICA E INFORMATICA. |
Contenuti | |
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MODULO 1 ADVANCED BIOINFORMATICS ALLINEAMENTO MULTIPLO DI SEQUENZE 2 ORE RICERCA CON MOTIVI E PATTERN2 ORE INTRODUZIONE AGLI ALBERI FILOGENETICI2 ORE ALGORITMI E METODI DI COSTRUZIONE6 ORE INTRODUZIONE ALLA SYSTEMS BIOLOGY4 ORE LABORATORIO: INTRODUZIONE ALLE METODOLOGIE IN USO2 ORE LABORATORIO: BAC6 ORE MODULO 2 ARCHITECTURES FOR BIOLOGICAL DATA PROCESSING ACCELERATED GPU COMPUTING4 ORE LABORATORIO: ACCELERATED GPU COMPUTING4 ORE TOOLS FOR ANALYSIS AND VISUALIZATION OF LARGE/DEEP NETWORKS4 ORE LABORATORIO: TOOLS FOR ANALYSIS AND VISUALIZATION OF LARGE/DEEP NETWORKS4 ORE ESERCITAZIONI: INTRODUZIONE ALLE METODOLOGIE IN USO2 ORE ESERCITAZIONI: BAC6 ORE |
Metodi Didattici | |
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LEZIONI FRONTALI, ESERCITAZIONI IN AULA ED ESPERIENZE DI LABORATORIO |
Verifica dell'apprendimento | |
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UN PROGETTO PER VERIFICARE LA CAPACITA' DI APPLICARE I MODELLI AI DATI BIOINFORMATICI UTILIZZANDO LE OPPORTUNE ARCHITETTURE |
Testi | |
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MARKETA ZVELEBIL, JEREMY O. BAUM: UNDERSTANDING BIOINFORMATICS, GARLAND SCIENCE 2008 IL MATERIALE PER LO STUDIO DELLE ARCHITETTURE, PER LE ESERCITAZIONI E LE ATTIVITÀ DI LABORATORIO, SIA PUR PRESENTE NEL TESTO CONSIGLIATO, VERRÀ INTEGRATO DURANTE IL CORSO DAL DOCENTE. |
Altre Informazioni | |
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E' RICHIESTA LA FREQUENZA REGOLARE AL CORSO SECONDO I CRITERI DEFINITI DALL’AREA DIDATTICA. Il corso è erogato in lingua inglese. |
BETA VERSION Fonte dati ESSE3 [Ultima Sincronizzazione: 2022-05-23]