BIO-INFORMATICA

Roberto TAGLIAFERRI BIO-INFORMATICA

0522500070
DIPARTIMENTO DI INFORMATICA
CORSO DI LAUREA MAGISTRALE
INFORMATICA
2015/2016

ANNO CORSO 2
ANNO ORDINAMENTO 2010
PRIMO SEMESTRE
CFUOREATTIVITÀ
648LEZIONE
Obiettivi
IL CORSO HA IL FINE DI ANALIZZARE CON STRUMENTI BIOINFORMATICI LE SEQUENZE E LE STRUTTURE NUCLEOTIDICHE E PROTEICHE; INTERROGARE EFFICACEMENTE LE BANCHE DATI BIOLOGICHE; UTILIZZARE METODI BIOINFORMATICI PER LA LOCALIZZAZIONE DI GENI IN GENOMI; UTILIZZARE METODI DI STATISTICA E DI APPRENDIMENTO AUTOMATICO PER L'ANALISI DI DATI FUNZIONALI DI GENOMICA.
Prerequisiti
SONO OPPORTUNE CONOSCENZE ELEMENTARI DI MATEMATICA E STASTICA, BIOLOGIA MOLECOLARE, BIOCHIMICA, INFORMATICA
Contenuti
1. GESTIONE, ANALISI E VISUALIZZAZIONE DI DATI MULTIMEDIALI. LE BANCHE DATI DI INTERESSE BIOLOGICO. RICERCA DI GENI IN BANCHE DATI; ANNOTAZIONE DI GENOMI PROCARIOTICI ED EUCARIOTICI. LE ONTOLOGIE.
2. ALCUNI CENNI DI MATEMATICA E STATISTICA PER LA BIOLOGIA.
3. ALLINEAMENTO DI SEQUENZE; MATRICI DI PUNTEGGIO E DOT-PLOT; ALLINEAMENTI MULTIPLI.
4. L’EVOLUZIONE DELLE PROTEINE; RICERCA IN BANCA DATI PER SIMILARITÀ; SIGNIFICATIVITÀ DELL’ALLINEAMENTO; RICONOSCIMENTO DI OMOLOGIA.
5. ALGORITMI DI ALLINEAMENTO: PROGRAMMAZIONE DINAMICA, FASTA, BLAST E HMM.
6. LA STRUTTURA E L’INTERPRETAZIONE DI ALBERI FILOGENETICI; EVOLUZIONE MOLECOLARE E SUE CONSEGUENZE; RICOSTRUZIONE DELL’ALBERO FILOGENETICO.
7. ANALISI DELL’ESPRESSIONE DEI GENI: I DATI DI ESPRESSIONE GENICA E ALCUNE TECNICHE DI ANALISI
8. ALGORITMI DI CLUSTERING E METODI STATISTICI: LA PREPARAZIONE DEI DATI DI ESPRESSIONE DEI GENI; ALCUNE TECNICHE DI ANALISI BASATE SUL CLUSTERING; ANALISI STATISTICHE PER QUANTIFICARE LA SIGNIFICATIVITÀ DELLE ESPRESSIONI DIFFERENZIALI; CLASSIFICAZIONE DEI CAMPIONI CON DATI DI ESPRESSIONE.
9. UN’INTRODUZIONE ALLA BIOLOGIA DEI SISTEMI.
Metodi Didattici
LEZIONI FRONTALI, ESERCITAZIONI IN AULA ED ESPERIENZE DI LABORATORIO
Verifica dell'apprendimento
PROVA SCRITTA
Testi
ANNA TRAMONTANO: BIOINFORMATICA, ZANICHELLI 2002

MARKETA ZVELEBIL, JEREMY O. BAUM: UNDERSTANDING BIOINFORMATICS, GARLAND SCIENCE 2008

APPUNTI E SLIDE DEL CORSO
Altre Informazioni
E' RICHIESTA LA FREQUENZA REGOLARE AL CORSO SECONDO I CRITERI DEFINITI DALL’AREA DIDATTICA.
  BETA VERSION Fonte dati ESSE3 [Ultima Sincronizzazione: 2016-09-30]