Roberto TAGLIAFERRI | BIO-INFORMATICA
Roberto TAGLIAFERRI BIO-INFORMATICA
cod. 0522500070
BIO-INFORMATICA
0522500070 | |
DIPARTIMENTO DI INFORMATICA | |
CORSO DI LAUREA MAGISTRALE | |
INFORMATICA | |
2015/2016 |
ANNO CORSO 2 | |
ANNO ORDINAMENTO 2010 | |
PRIMO SEMESTRE |
SSD | CFU | ORE | ATTIVITÀ | |
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INF/01 | 6 | 48 | LEZIONE |
Obiettivi | |
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IL CORSO HA IL FINE DI ANALIZZARE CON STRUMENTI BIOINFORMATICI LE SEQUENZE E LE STRUTTURE NUCLEOTIDICHE E PROTEICHE; INTERROGARE EFFICACEMENTE LE BANCHE DATI BIOLOGICHE; UTILIZZARE METODI BIOINFORMATICI PER LA LOCALIZZAZIONE DI GENI IN GENOMI; UTILIZZARE METODI DI STATISTICA E DI APPRENDIMENTO AUTOMATICO PER L'ANALISI DI DATI FUNZIONALI DI GENOMICA. |
Prerequisiti | |
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SONO OPPORTUNE CONOSCENZE ELEMENTARI DI MATEMATICA E STASTICA, BIOLOGIA MOLECOLARE, BIOCHIMICA, INFORMATICA |
Contenuti | |
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1. GESTIONE, ANALISI E VISUALIZZAZIONE DI DATI MULTIMEDIALI. LE BANCHE DATI DI INTERESSE BIOLOGICO. RICERCA DI GENI IN BANCHE DATI; ANNOTAZIONE DI GENOMI PROCARIOTICI ED EUCARIOTICI. LE ONTOLOGIE. 2. ALCUNI CENNI DI MATEMATICA E STATISTICA PER LA BIOLOGIA. 3. ALLINEAMENTO DI SEQUENZE; MATRICI DI PUNTEGGIO E DOT-PLOT; ALLINEAMENTI MULTIPLI. 4. L’EVOLUZIONE DELLE PROTEINE; RICERCA IN BANCA DATI PER SIMILARITÀ; SIGNIFICATIVITÀ DELL’ALLINEAMENTO; RICONOSCIMENTO DI OMOLOGIA. 5. ALGORITMI DI ALLINEAMENTO: PROGRAMMAZIONE DINAMICA, FASTA, BLAST E HMM. 6. LA STRUTTURA E L’INTERPRETAZIONE DI ALBERI FILOGENETICI; EVOLUZIONE MOLECOLARE E SUE CONSEGUENZE; RICOSTRUZIONE DELL’ALBERO FILOGENETICO. 7. ANALISI DELL’ESPRESSIONE DEI GENI: I DATI DI ESPRESSIONE GENICA E ALCUNE TECNICHE DI ANALISI 8. ALGORITMI DI CLUSTERING E METODI STATISTICI: LA PREPARAZIONE DEI DATI DI ESPRESSIONE DEI GENI; ALCUNE TECNICHE DI ANALISI BASATE SUL CLUSTERING; ANALISI STATISTICHE PER QUANTIFICARE LA SIGNIFICATIVITÀ DELLE ESPRESSIONI DIFFERENZIALI; CLASSIFICAZIONE DEI CAMPIONI CON DATI DI ESPRESSIONE. 9. UN’INTRODUZIONE ALLA BIOLOGIA DEI SISTEMI. |
Metodi Didattici | |
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LEZIONI FRONTALI, ESERCITAZIONI IN AULA ED ESPERIENZE DI LABORATORIO |
Verifica dell'apprendimento | |
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PROVA SCRITTA |
Testi | |
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ANNA TRAMONTANO: BIOINFORMATICA, ZANICHELLI 2002 MARKETA ZVELEBIL, JEREMY O. BAUM: UNDERSTANDING BIOINFORMATICS, GARLAND SCIENCE 2008 APPUNTI E SLIDE DEL CORSO |
Altre Informazioni | |
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E' RICHIESTA LA FREQUENZA REGOLARE AL CORSO SECONDO I CRITERI DEFINITI DALL’AREA DIDATTICA. |
BETA VERSION Fonte dati ESSE3 [Ultima Sincronizzazione: 2016-09-30]