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ARCHITECTURES AND SYSTEMS FOR BIOLOGICAL DATA PROCESSING

Roberto TAGLIAFERRI ARCHITECTURES AND SYSTEMS FOR BIOLOGICAL DATA PROCESSING

0622900005
DIPARTIMENTO DI INGEGNERIA DELL'INFORMAZIONE ED ELETTRICA E MATEMATICA APPLICATA
CORSO DI LAUREA MAGISTRALE
DIGITAL HEALTH AND BIOINFORMATIC ENGINEERING
2019/2020

ANNO CORSO 2
ANNO ORDINAMENTO 2018
PRIMO SEMESTRE
CFUOREATTIVITÀ
324LEZIONE
216LABORATORIO
18ESERCITAZIONE
ROBERTO TAGLIAFERRI T Curriculum
Obiettivi
L'INSEGNAMENTO HA IL FINE DI ANALIZZARE CON STRUMENTI BIOINFORMATICI LE SEQUENZE E LE STRUTTURE NUCLEOTIDICHE E PROTEICHE IN PARTICOLARE PER L'ALLINEAMENTO, LOCALE E GLOBALE, MULTIPLO DI SEQUENZE FONDAMENTALMENTE PROTEICHE, PER RILEVARE LA STRUTTURA E DARE UN'INTERPRETAZIONE AGLI ALBERI FILOGENETICI; CAPIRE LE BASI METODOLOGICHE DELLA BIOLOGIA DEI SISTEMI. ULTERIORMENTE HA COME OBBIETTIVO IL FORNIRE GLI STRUMENTI ARCHITETTURALI PER L’IMPLEMENTAZIONE DI MODELLI APPROPRIATI PER LA BIOLOGIA DEI SISTEMI E LA DIAGNOSTICA MEDICA.
Prerequisiti
SONO RICHIESTE OPPORTUNE CONOSCENZE ELEMENTARI DI BIOLOGIA MOLECOLARE, BIOINFORMATICA, MATEMATICA, STATISTICA E INFORMATICA.
Contenuti
MODULO 1 ADVANCED BIOINFORMATICS
ALLINEAMENTO MULTIPLO DI SEQUENZE 2 ORE
RICERCA CON MOTIVI E PATTERN2 ORE
INTRODUZIONE AGLI ALBERI FILOGENETICI2 ORE
ALGORITMI E METODI DI COSTRUZIONE6 ORE
INTRODUZIONE ALLA SYSTEMS BIOLOGY4 ORE
LABORATORIO: INTRODUZIONE ALLE METODOLOGIE IN USO2 ORE
LABORATORIO: BAC6 ORE

MODULO 2 ARCHITECTURES FOR BIOLOGICAL DATA PROCESSING
ACCELERATED GPU COMPUTING4 ORE
LABORATORIO: ACCELERATED GPU COMPUTING4 ORE
TOOLS FOR ANALYSIS AND VISUALIZATION OF LARGE NETWORKS4 ORE
LABORATORIO: TOOLS FOR ANALYSIS AND VISUALIZATION OF LARGE NETWORKS4 ORE
ESERCITAZIONI: INTRODUZIONE ALLE METODOLOGIE IN USO2 ORE
ESERCITAZIONI: BAC6 ORE
Metodi Didattici
LEZIONI FRONTALI, ESERCITAZIONI IN AULA ED ESPERIENZE DI LABORATORIO
Verifica dell'apprendimento
UN PROGETTO PER VERIFICARE LA CAPACITA' DI APPLICARE I MODELLI AI DATI BIOINFORMATICI UTILIZZANDO LE OPPORTUNE ARCHITETTURE
Testi
MARKETA ZVELEBIL, JEREMY O. BAUM: UNDERSTANDING BIOINFORMATICS, GARLAND SCIENCE 2008

IL MATERIALE PER LO STUDIO DELLE ARCHITETTURE, PER LE ESERCITAZIONI E LE ATTIVITÀ DI LABORATORIO, SIA PUR PRESENTE NEL TESTO CONSIGLIATO, VERRÀ INTEGRATO DURANTE IL CORSO DAL DOCENTE.
Altre Informazioni
E' RICHIESTA LA FREQUENZA REGOLARE AL CORSO SECONDO I CRITERI DEFINITI DALL’AREA DIDATTICA.
  BETA VERSION Fonte dati ESSE3 [Ultima Sincronizzazione: 2021-02-19]