Angelo FACCHIANO | Pubblicazioni
Angelo FACCHIANO Pubblicazioni
| 2024 | |
| Articolo in rivista | |
| Bioinformatics Study on Site-Specific Variations of Eotaxin-3, a Key Chemokine in Eosinophilic Esophagitis (EoE) GENES. Vol. 15. Pag.1-14 ISSN:2073-4425. | |
| Giordano, Deborah; D'Acierno, Antonio; Marabotti, Anna; Iovino, Paola; Iacomino, Giuseppe; Facchiano, Angelo | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.3390/genes15081073 Codice identificativo ISI: WOS:001304862000001 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85202454755 | |
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| 2024 | |
| Articolo in rivista | |
| Bioinformatics Study on Site-Specific Variations of Eotaxin-3, a Key Chemokine in Eosinophilic Esophagitis (EoE) GENES. Vol. 15. Pag.1-14 ISSN:2073-4425. | |
| Giordano, Deborah; D'Acierno, Antonio; Marabotti, Anna; Iovino, Paola; Iacomino, Giuseppe; Facchiano, Angelo | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.3390/genes15081073 Codice identificativo ISI: WOS:001304862000001 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85202454755 | |
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| 2023 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| The importance of data standardization for the analysis of structural files: a case report. In: BITS Meeting Pag.1-1 | |
| BITS Meeting 2023 Bari 21-23/6/2023 | |
| Scafuri, B; D'Arminio, Nancy; Giordano, D; Facchiano, A; Marabotti, A | |
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| 2023 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Predicting the effects of SARS-CoV-2 VoCs on human antibody interaction. In: ISMB-ECCB2023 Pag.1-1 | |
| ISMB-ECCB2023 Lyon, France 23-27/7/2023 | |
| D'Arminio, Nancy; Giordano, Deborah; Scafuri, B; Facchiano, A; Marabotti, A | |
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312206The importance of improving the FAIRness of structural data: a case report about spike analysis.
| 2023 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| The importance of improving the FAIRness of structural data: a case report about spike analysis.. In: SIB2023 Pag.1-1 | |
| SIB2023 Firenze 7-9/9/2023 | |
| D'Arminio, Nancy; Giordano, Deborah; Scafuri, B; Facchiano, A; Marabotti, A | |
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| 2023 | |
| Articolo in rivista | |
| Machine Learning as a Support for the Diagnosis of Type 2 Diabetes INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. Vol. 24. Pag.6775-1-6775-14 ISSN:1661-6596. | |
| Agliata, A.; Giordano, D.; Bardozzo, F.; Bottiglieri, S.; Facchiano, A.; Tagliaferri, R. | |
| Versione online | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.3390/ijms24076775 Codice identificativo ISI: WOS:000970204100001 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85152332526 | |
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| 2023 | |
| Articolo in rivista | |
| Standardizing macromolecular structure files: further efforts are needed TRENDS IN BIOCHEMICAL SCIENCES. Vol. 48. Pag.590-596 ISSN:0968-0004. | |
| D'Arminio, Nancy; Giordano, Deborah; Scafuri, Bernardina; Facchiano, Angelo; Marabotti, Anna | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1016/j.tibs.2023.03.002 Codice identificativo ISI: WOS:001021130400001 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85152668053 | |
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| 2023 | |
| Articolo in rivista | |
| Resources and tools for rare disease variant interpretation FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES. Vol. 10. Pag.1169109-1169109 ISSN:2296-889X. | |
| Licata, Luana; Via, Allegra; Turina, Paola; Babbi, Giulia; Benevenuta, Silvia; Carta, Claudio; Casadio, Rita; Cicconardi, Andrea; Facchiano, Angelo; Fariselli, Piero; Giordano, Deborah; Isidori, Federica; Marabotti, Anna; Martelli, Pier Luigi; Pascarella, Stefano; Pinelli, Michele; Pippucci, Tommaso; Russo, Roberta; Savojardo, Castrense; Scafuri, Bernardina; Valeriani, Lucrezia; Capriotti, Emidio | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.3389/fmolb.2023.1169109 Codice identificativo ISI: WOS:001000438900001 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85160058924 | |
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255823Omicron variants modelling and analysis of their relative effects on the human antibody interactions
| 2022 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Omicron variants modelling and analysis of their relative effects on the human antibody interactions. In: Proceedings of Meeting sezione SIB Campania Pag.1-1 | |
| Meeting Sezione SIB Campania 2022 Napoli 26/10/2022 | |
| D'Arminio, N; Vitulano, G; Scafuri, B; Giordano, D; Petrillo, M; Facchiano, A; Marabotti, A | |
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| 2022 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Effects of the Omicron variants on the interaction between Spike and human antibodies performed by a computational strategy. In: Proceedings of BBCC2022 Pag.1-1 | |
| BBCC2022 virtual conference 13-15/12/2022 | |
| D'Arminio, N; Vitulano, G; Scafuri, B; Giordano, D; Petrillo, M; Facchiano, A; Marabotti, A | |
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| 2022 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Modelling the effects of spike Omicron mutations on the antibody interactions. In: Proceedings of Proteine 2022 Pag.1-1 | |
| Proteine 2022 Pisa 18-20/5/2022 | |
| D'Arminio, N; Giordano, D; Scafuri, B; Biancaniello, C; Petrillo, M; Facchiano, A; Marabotti, A | |
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| 2022 | |
| Articolo in rivista | |
| Investigating the Effects of Amino Acid Variations in Human Menin MOLECULES. Vol. 27. Pag.1747-1747 ISSN:1420-3049. | |
| Biancaniello, Carmen; D’Argenio, Antonia; Giordano, Deborah; Dotolo, Serena; Scafuri, Bernardina; Marabotti, Anna; D’Acierno, Antonio; Tagliaferri, Roberto; Facchiano, Angelo | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.3390/molecules27051747 Codice identificativo ISI: WOS:000767981000001 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85126296937 | |
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| 2022 | |
| Articolo in rivista | |
| Molecular dynamics analysis of the structural properties of the transglutaminases of Kutzneria albida and Streptomyces mobaraensis COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL. Vol. 20. Pag.3924-3934 ISSN:2001-0370. | |
| Giordano, Deborah; Langini, Cassiano; Caflisch, Amedeo; Marabotti, Anna; Facchiano, Angelo | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1016/j.csbj.2022.07.024 Codice identificativo ISI: WOS:000889723800003 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85134879049 | |
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| 2022 | |
| Articolo in rivista | |
| In Silico Analysis of the Effects of Omicron Spike Amino Acid Changes on the Interactions with Human Proteins MOLECULES. Vol. 27. Pag.4827-4827 ISSN:1420-3049. | |
| D'Arminio, Nancy; Giordano, Deborah; Scafuri, Bernardina; Biancaniello, Carmen; Petrillo, Mauro; Facchiano, Angelo; Marabotti, Anna | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.3390/molecules27154827 Codice identificativo ISI: WOS:000839804900001 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85137028830 | |
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| 2021 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Mutations in the SARS-CoV-2 Spike protein and antibody interactions. In: Proceedings of BBCC2021 Pag.1-1 | |
| BBCC2021 virtuale 1-3/12/2021 | |
| Scafuri, B; D'Arminio, N; Alfieri, S; Petrillo, M; Querci, M; Van den Eede, G; Facchiano, A; Marabotti, A | |
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| 2021 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Performances evaluation of selected web tools predicting changes in protein stability. In: Proceedings of BITS Pag.1-1 | |
| BITS2021 virtuale 1-2/7/2021 | |
| Marabotti, A; Del Prete, E; Scafuri, B; Facchiano, A | |
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| 2021 | |
| Articolo in rivista | |
| Editorial: Computational Proteomics and Integration of Data Resources for Advanced Studies in Life Sciences FRONTIERS IN GENETICS. Vol. 12. Pag.729013-729013 ISSN:1664-8021. | |
| Marabotti, Anna; Romano, Paolo; Facchiano, Angelo | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.3389/fgene.2021.729013 Codice identificativo ISI: WOS:000681572800001 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85112608226 | |
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| 2021 | |
| Articolo in rivista | |
| Predicting the stability of mutant proteins by computational approaches: an overview BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS. Pag.1-1 ISSN:1467-5463. | |
| Marabotti, Anna; Scafuri, Bernardina; Facchiano, Angelo | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1093/bib/bbaa074 Codice identificativo ISI: WOS:000709461300026 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85107088729 | |
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| 2021 | |
| Articolo in rivista | |
| A multiple network-based bioinformatics pipeline for the study of molecular mechanisms in oncological diseases for personalized medicine BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS. Pag.1-13 ISSN:1467-5463. | |
| Dotolo, Serena; Marabotti, Anna; Rachiglio, Anna Maria; Esposito Abate, Riziero; Benedetto, Marco; Ciardiello, Fortunato; De Luca, Antonella; Normanno, Nicola; Facchiano, Angelo; Tagliaferri, Roberto | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1093/bib/bbab180 Codice identificativo ISI: WOS:000733325700051 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85121949448 | |
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| 2021 | |
| Articolo in rivista | |
| A review on drug repurposing applicable to COVID-19 BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS. Vol. 22. Pag.726-741 ISSN:1467-5463. | |
| Dotolo, Serena; Marabotti, Anna; Facchiano, Angelo; Tagliaferri, Roberto | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1093/bib/bbaa288 Codice identificativo ISI: WOS:000642298000010 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85103474382 | |
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| 2021 | |
| Articolo in rivista | |
| Performance of Web tools for predicting changes in protein stability caused by mutations BMC BIOINFORMATICS. Vol. 22. Pag.345-345 ISSN:1471-2105. | |
| Marabotti, Anna; Del Prete, Eugenio; Scafuri, Bernardina; Facchiano, Angelo | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1186/s12859-021-04238-w Codice identificativo ISI: WOS:000669880600001 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85109310066 | |
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| 2020 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Assessing the performances of protein stability predictors. In: Proceedings of BBCC2020 Pag.1-1 | |
| BBCC2020 virtuale 16-18/11/2020 | |
| Marabotti, A; Del Prete, E; Scafuri, B; Facchiano, A | |
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| 2019 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| A web-based tool to annotate the effects of amino acid variations on structure, function and stability. In: ELIXIR AHM Pag.00-00 | |
| Elixir-EXCELERATE All Hands Meeting Lisbona (Portogallo) 17-20/6/2019 | |
| Marabotti, A; D'Acierno, A; Scafuri, B; Facchiano, A | |
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| 2019 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Expanding the information about Galactosemias: simulation of the effects of mutations affecting galactose mutarotase. In: Proceedings of BITS2019 Pag.00-00 | |
| BITS 2019-16th Annual Meeting of Bioinformatics Italian Society Palermo 26-28/6/2019 | |
| D’Acierno, A; Facchiano, A; Brando, F; Scafuri, B; Marabotti, A | |
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| 2019 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| ELIXIR-IT Industry engagement: overview of the work in progress. In: ELIXIR AHM Pag.00-00 | |
| Elixir-EXCELERATE All Hands Meeting Lisbona (Portogallo) 17-20/6/2019 | |
| Facchiano, A; De Leo, F; Casadio, R; Marabotti, A; Mauri, G; Pesole, G; Zambelli, F | |
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| 2019 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Expansion of Galactosemia Proteins Database 2.0 with a new galactosemia-related protein. In: ELIXIR AHM Pag.00-00 | |
| Elixir-EXCELERATE All Hands Meeting Lisbona (Portogallo) 1720/6/2019 | |
| D'Acierno, A; Facchiano, A; Brando, F; Scafuri, B; Marabotti, A | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.7490/f1000research.1117950.1 | |
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150329Searching for Chymase Inhibitors among Chamomile Compounds Using a Computational-Based Approach
| 2019 | |
| Articolo in rivista | |
| Searching for Chymase Inhibitors among Chamomile Compounds Using a Computational-Based Approach BIOMOLECULES. Vol. 9. Pag.5-5 ISSN:2218-273X. | |
| Dubey, Amit; Dotolo, Serena; Ramteke, Pramod W.; Facchiano, Angelo; Marabotti, Anna | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.3390/biom9010005 Codice identificativo ISI: WOS:000458051700005 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85058918932 | |
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| 2018 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Prediction of the stability of proteins by computational approaches: a case report.. In: Proceedings of BBCC2018 Pag.0-0 | |
| BBCC2018 (International conference on Bioinformatics and Computational Biology) Naples 19-21/11/2018 | |
| Scafuri, Bernardina; Facchiano, A; Marabotti, A | |
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| 2018 | |
| Articolo in rivista | |
| The evolution of a Web resource: The Galactosemia Proteins Database 2.0 HUMAN MUTATION. Vol. 39. Pag.52-60 ISSN:1059-7794. | |
| D'Acierno, Antonio; Scafuri, Bernardina; Facchiano, Angelo; Marabotti, Anna | |
| Versione online | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1002/humu.23346 Codice identificativo ISI: WOS:000417572000004 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85037671116 | |
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| 2017 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Prediction of the effects of amino acid mutations on protein stability: an analysis of available tools and their reliability. In: Proceedings of BBCC2017 Pag.0-0 | |
| BBCC2017 - International conference on Bioinformatics and Computational Biology Napoli 18-20/12/2017 | |
| Scafuri, B; Facchiano, A; Marabotti, A | |
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| 2017 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| A complete Web resource for Galactosemia-related proteins. In: Proceedings of ISMB-ECCB 2017 Pag.0-0 | |
| Joint 25th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 16th European Conference on Computational Biology Praga 21-25/7/2017 | |
| Marabotti, A; Scafuri, B; D’Acierno, A; Facchiano, A | |
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| 2017 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| A Web-accessible database for Galactosemia-related proteins. In: BITS 2017 ProceedingsVol.2017, Pag.115-116 | |
| BITS 2017-14th Annual Meeting of Bioinformatics Italian Society Cagliari 5-8/7/2017 | |
| 119., Scafuri B; D'Acierno, A; Facchiano, A; Marabotti, A | |
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| 2017 | |
| Articolo in rivista | |
| Binding of mycotoxins to proteins involved in neuronal plasticity: a combined in silico/wet investigation SCIENTIFIC REPORTS. Vol. 7. Pag.15156-15156 ISSN:2045-2322. | |
| Scafuri, Bernardina; Varriale, Antonio; Facchiano, Angelo; D'Auria, Sabato; Raggi, Maria Elisabetta; Marabotti, Anna | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1038/s41598-017-15148-4 Codice identificativo ISI: WOS:000414810600039 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-85033708337 | |
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| 2016 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Computational screening and bioinformatics functional analysis for the investigation of apple polyphenols chemopreventive effects in cancer. In: Proceedings of BITS2016 Pag.N/A-N/A | |
| BITS2016 Fisciano (SA) 15-17/6/2016 | |
| Scafuri, Bernardina; Marabotti, Anna; Carbone, Virginia; Minasi, Paola; Dotolo, Serena; Facchiano, Angelo | |
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| 2016 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Biclustering of gene expression data with GRASP approximate algorithm. In: Proceedings of BITS2016 Pag.N/A-N/A | |
| BITS2016 Fisciano (SA) 15-17/6/2016 | |
| Ferone, Daniele; Facchiano, Angelo; Marabotti, Anna; Festa, Paola | |
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| 2016 | |
| Abstract in rivista | |
| A computational study to identify potential inhibitors for human chymase from natural and/or biogenic sources PEERJ. Pag.N/A-N/A ISSN:2167-8359. | |
| Dubey, Amit; Marabotti, Anna; Ramteke, Pramod W; Facchiano, Angelo | |
| Digital Object Identifier (DOI): doi:10.7287/peerj.preprints.2185v1 | |
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| 2016 | |
| Abstract in rivista | |
| Nutraceutical search through the pipeline of pharmacophore-based virtual screening PEERJ. Pag.N/A-N/A ISSN:2167-8359. | |
| Dubey, Amit; Del Prete, Eugenio; Dotolo, Serena; Gaeta, Angelo; Marabotti, Anna; Ramteke, Pramod W; Facchiano, Angelo | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.7287/peerj.preprints.1690v1 | |
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| 2016 | |
| Abstract in rivista | |
| Feature selection on a dataset of protein families: from exploratory data analysis to statistical variable importance PEERJ. Pag.N/A-N/A ISSN:2167-8359. | |
| Del Prete, Eugenio; Dotolo, Serena; Marabotti, Anna; Facchiano, Angelo | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.7287/peerj.preprints.2157v1 | |
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| 2016 | |
| Abstract in rivista | |
| Molecular simulations for investigating the role of food polyphenols in human health PEERJ. Pag.N/A-N/A ISSN:2167-8359. | |
| Scafuri, Bernardina; Marabotti, Anna; Facchiano, Angelo | |
| Digital Object Identifier (DOI): doi:10.7287/peerj.preprints.2658v1 | |
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| 2016 | |
| Abstract in rivista | |
| A new GRASP metaheuristic for biclustering of gene expression data PEERJ. Pag.N/A-N/A ISSN:2167-8359. | |
| Ferone, Daniele; Facchiano, Angelo; Marabotti, Anna; Festa, Paola | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.7287/peerj.preprints.1679v1 | |
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| 2016 | |
| Abstract in rivista | |
| GALACTOSEMIA Web DB: A Web-accessible database of Galactosemia-related proteins PEERJ. Pag.N/A-N/A ISSN:2167-8359. | |
| D'Acierno, Antonio; Facchiano, Angelo; Marabotti, Anna | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.7287/peerj.preprints.1645v1 | |
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| 2016 | |
| Articolo in rivista | |
| A theoretical study on predicted protein targets of apple polyphenols and possible mechanisms of chemoprevention in colorectal cancer SCIENTIFIC REPORTS. Vol. 6. Pag.32516-32516 ISSN:2045-2322. | |
| Scafuri, Bernardina; Marabotti, Anna; Carbone, Virginia; Minasi, Paola; Dotolo, Serena; Facchiano, Angelo | |
| Versione online | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1038/srep32516 Codice identificativo ISI: WOS:000382393600001 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-84985911661 | |
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| 2016 | |
| Articolo in rivista | |
| In silico approach to find chymase inhibitors among biogenic compounds FUTURE MEDICINAL CHEMISTRY. Vol. 8. Pag.841-851 ISSN:1756-8919. | |
| Dubey, Amit; Facchiano, Angelo; Ramteke, Pramod W; Marabotti, Anna | |
| Versione online | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.4155/fmc-2016-0030 Codice identificativo ISI: WOS:000377986400002 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-84971482895 | |
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| 2016 | |
| Articolo in rivista | |
| Interaction of human chymase with ginkgolides, terpene trilactones of Ginkgo biloba investigated by molecular docking simulations BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS. Vol. 473. Pag.449-454 ISSN:0006-291X. | |
| Dubey, Amit; Marabotti, Anna; Ramteke, Pramod W.; Facchiano, Angelo | |
| Versione online | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1016/j.bbrc.2016.03.028 Codice identificativo ISI: WOS:000374809700014 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-84961233803 | |
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| 2016 | |
| Articolo in rivista | |
| PDGFR-alpha inhibits melanoma growth via CXCL10/IP-10: a multi-omics approach ONCOTARGET. Vol. 7. Pag.77257-77275 ISSN:1949-2553. | |
| D'Arcangelo, Daniela; Facchiano, Francesco; Nassa, Giovanni; Stancato, Andrea; Antonini, Annalisa; Rossi, Stefania; Senatore, Cinzia; Cordella, Martina; Tabolacci, Claudio; Salvati, Annamaria; Tarallo, Roberta; Weisz, Alessandro; Facchiano, Angelo M; Facchiano, Antonio | |
| Versione online | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.18632/oncotarget.12629 Codice identificativo ISI: WOS:000389633400075 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-84997724765 | |
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| 2015 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Combinatorial optimization approaches for biclustering of gene expression data. In: Proceedings of BMTL Pag.N/A-N/A | |
| Bringing Mathematics to Life Napoli 19-21/10/2015 | |
| Ferone, D; Facchiano, Angelo; Marabotti, Anna; Festa, P. | |
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74253Galactosemia Proteins Database: a reference Web site for all galactosemia-related protein variants
| 2015 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Galactosemia Proteins Database: a reference Web site for all galactosemia-related protein variants. In: Proceedings of BITS2015 Pag.N/A-N/A | |
| BITS 2015-12th Annual Meeting of Bioinformatics Italian Society Milan 2-5/06/2015 | |
| D’Acierno, A; Facchiano, Angelo; Marabotti, Anna | |
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| 2015 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Comparison between heuristic and statistical analysis on protein structural properties. In: Proceedings of NETTAB 2015 Pag.N/A-N/A | |
| NETTAB 2015 Bari 14-16/10/2015 | |
| Del Prete, E; Dotolo, S; Marabotti, Anna; Facchiano, Angelo | |
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| 2015 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Exploratory data analysis applied on structural features selected from glycoside hydrolase subfamilies. In: Proceedings of BITS2015 Pag.N/A-N/A | |
| BITS 2015-12th Annual Meeting of Bioinformatics Italian Society Milan 2-5/06/2015 | |
| Del Prete, E; Dotolo, S; Marabotti, Anna; Facchiano, Angelo | |
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| 2015 | |
| Abstract in rivista | |
| Analysis of the binding of mycotoxins to proteins involved in ASD with a combined computational/experimental approach. PROTEIN SCIENCE. Vol. 24 Suppl. 1. Pag.264-264 ISSN:0961-8368. | |
| Scafuri, Bernardina; Varriale, A; Facchiano, Angelo; D’Auria, S; Raggi, Me; Marabotti, Anna | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1002/pro.2823 Codice identificativo ISI: WOS:000363658100438 | |
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| 2015 | |
| Articolo in rivista | |
| Clinical and molecular spectra in galactosemic patients from neonatal screening in northeastern Italy: structural and functional characterization of new variations in the galactose-1-phosphate uridyltransferase (GALT) gene GENE. Vol. 559. Pag.112-118 ISSN:0378-1119. | |
| Viggiano, E; Marabotti, Anna; Burlina, A. P; Cazzorla, C; D'Apice, M. R; Giordano, L; Fasan, I; Novelli, G; Facchiano, Angelo; Burlina, A. B. | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1016/j.gene.2015.01.013 Codice identificativo ISI: WOS:000350784300002 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-84922448810 | |
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| 2015 | |
| Articolo in rivista | |
| Preface: BITS2014, the annual meeting of the Italian Society of Bioinformatics BMC BIOINFORMATICS. Vol. 16 Suppl 9. Pag.S1-S1 ISSN:1471-2105. | |
| Facchiano, Angelo; Angelini, Claudia; Bosotti, Roberta; Guffanti, Alessandro; Marabotti, Anna; Marangoni, Roberto; Pascarella, Stefano; Romano, Paolo; Zanzoni, Andreas; Helmer Citterich, Manuela | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1186/1471-2105-16-S9-S1 Codice identificativo ISI: WOS:000367875300001 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-84943166246 | |
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| 2015 | |
| Contributo in Atti di convegno | |
| Statistical analysis of protein structural features: relationships and PCA grouping. In: Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics Basel Springer International Publishing Pag.33-43 ISBN:3319244620 | |
| 11th International Meeting CIBB 2014 Cambridge, UK June 26-28, 2014, | |
| Del Prete, Eugenio; Dotolo, Serena; Marabotti, Anna; Facchiano, Angelo | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1007/978-3-319-24462-4_3 Codice identificativo ISI: WOS:000366296700003 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-84949995110 | |
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| 2015 | |
| Contributo in Atti di convegno | |
| Ethno-Pharmacology Based In Silico Approach Tracing Chymase Inhibitors from Herbal Nutraceutical Resources. In: Proceedings of CIBB2015-12th International Meeting on Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics Department of Informatics, University of Salerno and Istituto per le Applicazioni del Calcolo “Mauro Picone” CNR Pag.N/A-N/A ISBN:9788890643798 | |
| CIBB2015-12th International Meeting on Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics Napoli 10-12/09/2015 | |
| Dubey, Amit; Marabotti, Anna; Ramteke, Pramod W; Facchiano, Angelo | |
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| 2015 | |
| Contributo in volume (Capitolo o Saggio) | |
| Basic exploratory proteins analysis with statistical methods applied on structural features. In Mathematical Models in Biology. Bringing Mathematics to Life Pag.173-187 Basel Springer International Publishing. ISBN:9783319234977 | |
| Del Prete, Eugenio; Dotolo, Serena; Marabotti, Anna; Facchiano, Angelo | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1007/978-3-319-23497-7_13 | |
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| 2015 | |
| Contributo in volume (Capitolo o Saggio) | |
| Inverse docking approaches. In From medicinal chemistry to food science: A transfer of in silico methods applications Pag.81-104 New York Nova Science Publishers. ISBN:9781634836050 | |
| Scafuri, Bernardina; Facchiano, Angelo; Marabotti, Anna | |
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| 2014 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Structural properties of protein families as markers of functional features. In: 11th Annual Meeting of Bioinformatics Italian Society Pag.211-211 | |
| 11th Annual Meeting of Bioinformatics Italian Society Roma 26-28/2/2014 | |
| E., Del Prete; S., Dotolo; Marabotti, Anna; Facchiano, Angelo | |
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| 2014 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| A new version of GALT protein database. In: 11th Annual Meeting of Bioinformatics Italian Society Pag.105-106 | |
| 11th Annual Meeting of Bioinformatics Italian Society Roma 26-28/2/2014 | |
| A., D'Acierno; Facchiano, Angelo; Marabotti, Anna | |
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| 2014 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Putative protein targets of mycotoxins in the context of autism spectrum disorders.. In: Proceedings of BBCC2014 Pag.N/A-N/A | |
| Bioinfornatica e Biologia Computazionale in Campania Avellino 28/11/2014 | |
| Scafuri, Bernardina; Varriale, A; Facchiano, Angelo; D’Auria, S; Raggi, Me; Marabotti, Anna | |
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| 2014 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Molecular simulations for investigating the beneficial effects of food antioxidants. In: Proceedings of NETTAB 2014 Pag.N/A-N/A | |
| NETTAB 2014 Torino 15-17/10/2014 | |
| Scafuri, Bernardina; Carbone, V; Marabotti, Anna; Facchiano, Angelo | |
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74265BEPA: Basic Exploratory Proteins Analysis with statistical methods applied on structural features
| 2014 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| BEPA: Basic Exploratory Proteins Analysis with statistical methods applied on structural features. In: Proceedings of BBCC Pag.N/A-N/A | |
| Del Prete, E; Dotolo, S; Marabotti, Anna; Facchiano, Angelo | |
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| 2014 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Molecular simulations for investigating the beneficial effects of food antioxidants. In: Proceedings of BBCC2014 Pag.N/A-N/A | |
| Bioinformatica e Biologia Computazionale in Campania Avellino 28/11/2014 | |
| Scafuri, Bernardina; Carbone, V; Marabotti, Anna; Facchiano, Angelo | |
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| 2014 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Putative protein targets of mycotoxins in the context of autism spectrum disorders. In: Proceedings of EMBO Conference Pag.N/A-N/A | |
| EMBO Conference Series: From functional genomics to systems biology Heidelberg (Germania) 8-11/11/2014 | |
| Scafuri, Bernardina; Varriale, A; Facchiano, Angelo; D’Auria, S; Raggi, Me; Marabotti, Anna | |
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| 2014 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Searching for targets of mycotoxins in the context of autism spectrum disorders: an example of computational approach. In: 11th Annual Meeting of Bioinformatics Italian Society Pag.218-219 | |
| 11th Annual Meeting of Bioinformatics Italian Society Roma 26-28/2/2014 | |
| Scafuri, Bernardina; Facchiano, Angelo; M. E., Raggi; Marabotti, Anna | |
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61150Structural features statistical analysis of two protein families: relationships and PCA grouping
| 2014 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Structural features statistical analysis of two protein families: relationships and PCA grouping. In: Proceedings of CIBB Pag.1-1 | |
| 11th InternationalMeeting on Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics Cambridge (UK) 26-28/6/2014 | |
| E., Del Prete; S., Dotolo; Marabotti, Anna; Facchiano, Angelo | |
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| 2014 | |
| Abstract in rivista | |
| Long-term follow up in a cohort of galactosemic patients detected by newborn screening JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE. Vol. 37 Suppl.1. Pag.S103-S103 ISSN:0141-8955. | |
| Burlina, A; Viggiano, E; Politano, L; Facchiano, Angelo; Marabotti, Anna; Celato, A; Cazzorla, C; Giordano, L; Burlina, Ap | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1007/s10545-014-9740-5 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-84938895911 | |
| Visualizza sul Database dei Prodotti (IRIS) |
| 2014 | |
| Abstract in rivista | |
| Towards a fully comprehensive galactosemia proteins database JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE. Vol. 37 Suppl.1. Pag.S101-S101 ISSN:0141-8955. | |
| D'Acierno, A; Facchiano, Angelo; Marabotti, Anna | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1007/s10545-014-9740-5 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-84938895911 | |
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| 2014 | |
| Articolo in rivista | |
| GALT Protein Database: querying structural and functional features of GALT enzyme HUMAN MUTATION. Vol. 35. Pag.1060-1067 ISSN:1098-1004. | |
| D'Acierno, Antonio; Facchiano, Angelo; Marabotti, Anna | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1002/humu.22613 Codice identificativo ISI: WOS:000340557900004 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-84906056147 | |
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| 2013 | |
| Abstract in Atti di convegno | |
| Computational analysis of interactions between mycotoxins and proteins putatively involved in autism spectrum disorders. In: BBCC2013-Abstract book Pag.30-30 | |
| Bioinformatica e Biologia Computazionale in Campania-BBCC2013- 8° edizione Avellino 15/11/2013 | |
| Scafuri, Bernardina; Facchiano, Angelo; Raggi, Me; Marabotti, Anna | |
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| 2012 | |
| Articolo in rivista | |
| Mutation spectrum in the French cohort of galactosemic patients and structural simulation of 27 novel missense variations. MOLECULAR GENETICS AND METABOLISM. Vol. 107. Pag.438-447 ISSN:1096-7192. | |
| Boutron, A; Marabotti, Anna; Facchiano, A; Cheillan, D; Zater, M; Oliveira, C; Costa, C; Labrune, P; Brivet, M; Loisel, N; Morin, G; Barth, M; Altuzarra, C; Mesli, S; Rigalleau, V; Rhead, Mh; de Schrevel, G; Thauvin Robinet, C; Santos, A; Dobbelaere, D; Mention, K; Guffon, N; Cano, A; Feillet, F; Krempf, P; Pitelet, G; Bernard, O; Hermeziu, B; Gonzalez, E; Habes, D; Jacquemin, E; de Baulny, H; Roche, S; Debray, D; de Lonlay, P; Servais, A; Touati, G; Bednarek, N; Garnotel, R; Devaux, Am; Gay, C; Eyer, D; Baruteau, J; Broué, P; Labarthe, F; Maillot, F. | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1016/j.ymgme.2012.07.025 Codice identificativo ISI: WOS:000310720200028 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-84867895538 | |
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| 2012 | |
| Articolo in rivista | |
| Correlation assessment among clinical phenotypes, expression analysis and molecular modeling of 14 novel variations in the human galactose-1-phosphate uridylyltransferase gene. HUMAN MUTATION. Vol. 33. Pag.1107-1115 ISSN:1059-7794. | |
| Tang, M; Facchiano, A; Rachamadugu, R; Calderon, F; Mao, R; Milanesi, L; Marabotti, Anna; Lai, K. | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1002/humu.22093 Codice identificativo ISI: WOS:000304815100015 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-84861886186 | |
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50746Solving biclustering with a GRASP-like metaheuristic: two case-study on gene expression analysis
| 2012 | |
| Contributo in Atti di convegno | |
| Solving biclustering with a GRASP-like metaheuristic: two case-study on gene expression analysis. In: Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics Berlin Springer Verlag Vol.7548, Pag.253-267 ISBN:9788890643705 | |
| 8th International Meeting on Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics (CIBB2011) Gargnano del Garda, Italy June 30 – July 2, 2011 | |
| Facchiano, Angelo; Festa, Paola; Marabotti, Anna; Milanesi, Luciano; Musacchia, Francesco | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1007/978-3-642-35686-5_21 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-84871578747 | |
| Visualizza sul Database dei Prodotti (IRIS) |
| 2011 | |
| Articolo in rivista | |
| Human aryl-hydrocarbon receptor and its interaction with dioxin and physiological ligands investigated by molecular modelling and docking simulations BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS. Vol. 413. Pag.176-181 ISSN:0006-291X. | |
| Salzano, M; Marabotti, Anna; Milanesi, L; Facchiano, A. | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1016/j.bbrc.2011.08.039 Codice identificativo ISI: WOS:000295443400005 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-80053116897 | |
| Visualizza sul Database dei Prodotti (IRIS) |
| 2011 | |
| Articolo in rivista | |
| Identification of proteins associated with ligand-activated estrogen receptor alpha in human breast cancer cell nuclei by tandem affinity purification and nanoLC-MS/MS. PROTEOMICS. Vol. 11. Pag.172-179 ISSN:1615-9853. | |
| Tarallo, Roberta; Bamundo, A; Nassa, Giovanni; Nola, E; Paris, O; Ambrosino, C; Facchiano, A; Baumann, M; NYMAN T., A; Weisz, Alessandro | |
| Versione online | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1002/pmic.201000217 Codice identificativo ISI: WOS:000285884000017 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-78650360165 | |
| Visualizza sul Database dei Prodotti (IRIS) |
| 2011 | |
| Contributo in Atti di convegno | |
| A computational strategy to investigate relevant similarities between virus and human proteins - Local high similarities between herpes and human proteins. In: Bioinformatics 2011 - International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms SciTePress Vol.2011, Pag.183-188 ISBN:9789898425362 | |
| BIOSTEC 2011 Roma 26-29/01/2011 | |
| Marabotti, Anna; Cirielli, C; D'Arcangelo, Da; Giampietri, C; Facchiano, F; Facchiano, A; Facchiano, A. | |
| Codice identificativo ISI: WOS:000308455800029 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-79960194012 | |
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| 2010 | |
| Articolo in rivista | |
| The misuse of terms in scientific literature BIOINFORMATICS. Vol. 26. Pag.2498-2498 ISSN:1367-4803. | |
| Marabotti, Anna; Facchiano, A. | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1093/bioinformatics/btq438 Codice identificativo ISI: WOS:000282170000033 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-77957245237 | |
| Visualizza sul Database dei Prodotti (IRIS) |
49978Analysis of galactosemia-linked mutations of GALT enzyme using a computational biology approach
| 2010 | |
| Articolo in rivista | |
| Analysis of galactosemia-linked mutations of GALT enzyme using a computational biology approach PROTEIN ENGINEERING, DESIGN & SELECTION. Vol. 23. Pag.103-113 ISSN:1741-0126. | |
| Facchiano, A; Marabotti, Anna | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1093/protein/gzp076 Codice identificativo ISI: WOS:000274286200006 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-75649089285 | |
| Visualizza sul Database dei Prodotti (IRIS) |
| 2010 | |
| Contributo in volume (Capitolo o Saggio) | |
| Critical assessment of side chain conformation prediction in modelling of single point amino acid mutation. In Advances in Computational Biology Pag.283-289 Springer International Publishing AG. ISBN:978-1-4419-5912-6 ISSN:0065-2598. | |
| Marabotti, Anna; Facchiano, A. | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1007/978-1-4419-5913-3_32 Codice identificativo ISI: WOS:000283006100032 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-79952201381 | |
| Visualizza sul Database dei Prodotti (IRIS) |
| 2009 | |
| Articolo in rivista | |
| When it comes to homology, bad habits die hard TRENDS IN BIOCHEMICAL SCIENCES. Vol. 34. Pag.98-99 ISSN:0968-0004. | |
| Marabotti, Anna; Facchiano, A. | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1016/j.tibs.2008.12.001 Codice identificativo ISI: WOS:000265358700002 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-62949095910 | |
| Visualizza sul Database dei Prodotti (IRIS) |
| 2009 | |
| Articolo in rivista | |
| GALT protein database, a bioinformatics resource for the management and analysis of structural features of a galactosemia-related protein and its mutants GENOMICS, PROTEOMICS & BIOINFORMATICS. Vol. 7. Pag.71-76 ISSN:1672-0229. | |
| D'Acierno, A; Facchiano, A; Marabotti, Anna | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1016/S1672-0229(08)60035-2 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-67649666838 | |
| Visualizza sul Database dei Prodotti (IRIS) |
| 2009 | |
| Articolo in rivista | |
| Biochemical characterization and homology modeling of a purine-specific ribonucleoside hydrolase from the archaeon Sulfolobus solfataricus: insights into mechanisms of protein stabilization ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS. Vol. 483. Pag.55-65 ISSN:0003-9861. | |
| Porcelli, M; Peluso, I; Marabotti, Anna; Facchiano, A; Cacciapuoti, G. | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1016/j.abb.2008.12.005 Codice identificativo ISI: WOS:000263854400008 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-59849122116 | |
| Visualizza sul Database dei Prodotti (IRIS) |
| 2008 | |
| Articolo in rivista | |
| Energy-based prediction of amino acid-nucleotide base recognition JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY. Vol. 29. Pag.1955-1969 ISSN:0192-8651. | |
| Marabotti, Anna; Spyrakis, F; Facchiano, A; Cozzini, P; Alberti, S; Kellogg, Ge; Mozzarelli, A. | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1002/jcc.20954 Codice identificativo ISI: WOS:000258015500010 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-47549102750 | |
| Visualizza sul Database dei Prodotti (IRIS) |
| 2008 | |
| Articolo in rivista | |
| Pyrimidine-specific ribonucleoside hydrolase from the archaeon Sulfolobus solfataricus: biochemical characterization and homology modeling THE FEBS JOURNAL. Vol. 275. Pag.1900-1914 ISSN:1742-464X. | |
| Porcelli, M; Concilio, L; Peluso, I; Marabotti, Anna; Facchiano, A; Cacciapuoti, G. | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1111/j.1742-4658.2008.06348.x Codice identificativo ISI: WOS:000254499500027 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-41549084688 | |
| Visualizza sul Database dei Prodotti (IRIS) |
| 2007 | |
| Articolo in rivista | |
| New computational strategy to analyze the interactions of ERalpha and ERbeta with different ERE sequences JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY. Vol. 28. Pag.1031-1041 ISSN:0192-8651. | |
| Marabotti, Anna; Colonna, G; Facchiano, A. | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1002/jcc.20582 Codice identificativo ISI: WOS:000245029500004 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-33947728291 | |
| Visualizza sul Database dei Prodotti (IRIS) |
| 2007 | |
| Articolo in rivista | |
| A novel point mutation in the ligand-binding domain of the human glucocorticoid receptor (hGR) in a patient with glucocorticoid resistance INTERNATIONAL JOURNAL ON DISABILITY AND HUMAN DEVELOPMENT. Vol. 6. Pag.105-112 ISSN:2191-1231. | |
| Cannavo', S; Karl, M; Santarpia, L; Facchiano, A; Marabotti, Anna; Trimarchi, F; Benvenga, S. | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1515/IJDHD.2007.6.1.105 Codice identificativo ISI: WOS:000254007800015 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-56149123386 | |
| Visualizza sul Database dei Prodotti (IRIS) |
| 2006 | |
| Articolo in rivista | |
| Assessment of the conformational features of Vasoactive Intestinal Peptide in solution by limited proteolysis experiments BIOPOLYMERS. Vol. 81. Pag.110-119 ISSN:0006-3525. | |
| Stiuso, P; Marabotti, Anna; Facchiano, A; Lepretti, M; Dicitore, A; Ferranti, P; Carteni', M. | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1002/bip.20385 Codice identificativo ISI: WOS:000234761600006 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-33645560909 | |
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| 2005 | |
| Articolo in rivista | |
| Homology modeling studies on human Galactose-1-phosphate uridylyltransferase and on its galactosemia-related mutant Q188R provide an explanation of molecular effects of the mutation on homo- and heterodimers JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY. Vol. 48. Pag.773-779 ISSN:0022-2623. | |
| Marabotti, Anna; Facchiano, Am | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1021/jm049731q Codice identificativo ISI: WOS:000226881300014 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-13444291908 | |
| Visualizza sul Database dei Prodotti (IRIS) |
| 2004 | |
| Articolo in rivista | |
| Theoretical model of the three-dimensional structure of a sugar-binding protein from Pyrococcus horikoshii: structural analysis and sugar-binding simulations BIOCHEMICAL JOURNAL. Vol. 380. Pag.677-684 ISSN:0264-6021. | |
| Marabotti, Anna; D'Auria, S; Rossi, M; Facchiano, Am | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1042/BJ20031876 Codice identificativo ISI: WOS:000222338100011 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-3042739157 | |
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| 2004 | |
| Articolo in rivista | |
| A thermostable Sugar-Binding Protein from the archaeon Pyrococcus horikoshii as a probe for the development of a stable fluorescence biosensor for diabetic patients BIOTECHNOLOGY PROGRESS. Vol. 20. Pag.1572-1577 ISSN:8756-7938. | |
| Staiano, M; Sapio, Mr; Scognamiglio, V; Marabotti, Anna; Facchiano, Am; Bazzicalupo, P; Rossi, M; D'Auria, S. | |
| Digital Object Identifier (DOI): 10.1021/bp049857g Codice identificativo ISI: WOS:000224377700036 Codice identificativo SCOPUS: 2-s2.0-5444238423 | |
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