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TECNICHE OMICHE

Jacopo Troisi TECNICHE OMICHE

0522100022
DIPARTIMENTO DI CHIMICA E BIOLOGIA "ADOLFO ZAMBELLI"
CORSO DI LAUREA MAGISTRALE
BIOLOGIA
2021/2022

OBBLIGATORIO
ANNO CORSO 2
ANNO ORDINAMENTO 2016
PRIMO SEMESTRE
CFUOREATTIVITÀ
540LEZIONE
112ESERCITAZIONE
ANGELO FACCHIANO T Curriculum
JACOPO TROISI Curriculum
Obiettivi
CONOSCENZE E CAPACITA' DI COMPRENSIONE:
IL CORSO È FINALIZZATO A FORNIRE CONOSCENZE E COMPRENSIONE DELLE NUOVE TECNOLOGIE UTILIZZATE NELL’AMBITO DELLE SCIENZE OMICHE.

CAPACITA' DI APPLICARE CONOSCENZE E COMPRENSIONE:
IN PARTICOLARE, LO STUDENTE CONOSCERÀ E SARÀ IN GRADO DI APPLICARE LE CONOSCENZE ACQUISITE SULLE NUOVE TECNICHE DI SEQUENZIAMENTO DEL DNA (NEXT GENERATION SEQUENCING E TERZA GENERAZIONE), LE DIVERSE POSSIBILITÀ DI APPLICAZIONE E I PRINCIPALI PROGETTI INTERNAZIONALI IN CUI VENGONO LARGAMENTE UTILIZZATE. INOLTRE, VENGONO AFFRONTATE LE TEMATICHE DELLA PROTEOMICA (SISTEMATICA, DIFFERENZIALE, FUNZIONALE, STRUTTURALE) E LE TECNOLOGIE UTILIZZATE NELLE ALTRE APPLICAZIONI "OMICHE" PER LA COMPRENSIONE DI PROCESSI BIOLOGICI.
Prerequisiti
PRINCIPI E TECNICHE CLASSICHE DI LABORATORIO IN BIOCHIMICA E BIOLOGIA MOLECOLARE
Contenuti
INTRODUZIONE ALLE TECNICHE OMICHE - L’INTUIZIONE DEL “PROGETTO GENOMA UMANO” E LA VISIONE “OMICA”. LE PRIME APPLICAZIONI E LE ORIGINI DELLE DISCIPLINE OMICHE (CIRCA 2 ORE DI LEZIONE FRONTALE).
SEQUENZIAMENTO DEL DNA - METODO DI MAXAM-GILBERT, METODO DI SANGER, SEQUENZIAMENTO AUTOMATICO. NEXT-GENERATION SEQUENCING (NGS): 454-ROCHE; SOLEXA-ILLUMINA; SOLID-APPIED BIOSYSTEMS; POLONATOR; ION-TORRENT; NANOPORE SEQUENCING. COMPARAZIONE DEI METODI E APPLICAZIONI (CIRCA 8 ORE DI LEZIONE FRONTALE).
TRASCRITTOMICA: BASI MOLECOLARI, METODOLOGIE, APPLICAZIONI. I MICROARRAYS. PREPARAZIONE DEI CAMPIONI, TIPOLOGIE DI PIATTAFORME, ANALISI DEI DATI. SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS. RNASEQ. ALTRI METODI PER LO STUDIO DELLA TRASCRITTOMICA (CIRCA 8 ORE DI LEZIONE FRONTALE).
RNA INTERFERENCE - STRUTTURA, GENOMICA, BIOSINTESI, FUNZIONE DEI MICRORNA. APPLICAZIONI (CIRCA 4 ORE DI LEZIONE FRONTALE).
PROTEOMICA - PROTEOMICA DIFFERENZIALE, PROTEOMICA FUNZIONALE, PROTEOMICA STRUTTURALE. SPETTROMETRIA DI MASSA (CIRCA 8 ORE DI LEZIONE FRONTALE).
INTERAZIONI PROTEINA-PROTEINA. METODI SPERIMENTALI E BIOINFORMATICI PER LA DETERMINAZIONE DELLA STRUTTURA DELLE PROTEINE. INTERAZIONE DNA-PROTEINE (CIRCA 4 ORE DI LEZIONE FRONTALE).
BIOLOGIA DEI SISTEMI - INTRODUZIONE ALLA BIOLOGIA DEI SISTEMI: PROPRIETÀ EMERGENTI, RETI, MODELLI STATICI E MODELLI DINAMICI. ESEMPIO APPLICATIVI (CIRCA 3 ORE DI LEZIONE FRONTALE).
BIOINFORMATICA PER LE SCIENZE OMICHE - ANALISI ED INTERPRETAZIONE DEI DATI SPERIMENTALI DA APPROCCI “OMICI”. GENE ONTOLOGY. STRUMENTI DELLA BIOINFORMATICA PER L’INTEGRAZIONE DELLE INFORMAZIONI DA STUDI DI GENOMICA, TRASCRITTOMICA, PROTEOMICA (CIRCA 3 ORE DI LEZIONE FRONTALE).
METABOLOMICA - ANALISI ED INTERPRETAZIONE DEI DATI (12 ORE DI ESERCITAZIONI)
Metodi Didattici
IL CORSO SI SVOLGE MEDIANTE LEZIONI FRONTALI E DIMOSTRAZIONI PRATICHE MEDIANTE SIMULAZIONI AL COMPUTER DI ANALISI DATI, CONSULTAZIONE DI ARCHIVI ONLINE E USO DI STRUMENTI BIOINFORMATICI MEDIANTE WEB SERVER. PER I CONTENTUTI DI METABOLOMICA SONO PREVISTE ESERCITAZIONI PRATICHE.
Verifica dell'apprendimento
LA PROVA D’ESAME SI SVOLGE IN FORMA DI PROVA ORALE, AL TERMINE DEL CORSO, MEDIANTE UN COLLOQUIO MIRATO A VERIFICARE IL GRADO DI CONOSCENZA E COMPRENSIONE DEI CONTENUTI DELL'INSEGNAMENTO. IL COLLOQUIO VERTE SU ARGOMENTI DEL PROGRAMMA, SU CUI LO STUDENTE E' CHIAMATO A DIMOSTRARE SIA LA COMPRENSIONE DELLE TECNICHE, SIA DELLE APPLICAZIONI POSSIBILI.
Testi
MATERIALE DISTRIBUITO AL TERMINE DELLE LEZIONI (DIAPOSITIVE DELLE LEZIONI, ARTICOLI SCIENTIFICI, VIDEO DISPONIBILI ONLINE).

Altre Informazioni
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  BETA VERSION Fonte dati ESSE3 [Ultima Sincronizzazione: 2022-11-21]